Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA4P35212 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA4P35212 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA4P35212 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA4P35212 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms