Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPC1P35052 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPC1P35052 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPC1P35052 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPC1P35052 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPC1P35052 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPC1P35052 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPC1P35052 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPC1P35052 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPC1P35052 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms