Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms