Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA5P30532 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CHRNA5P30532 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA5P30532 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA5P30532 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA5P30532 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA5P30532 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA5P30532 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA5P30532 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA5P30532 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms