Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP1P29466 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP1P29466 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP1P29466 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP1P29466 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP1P29466 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP1P29466 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms