Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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