Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTGFP29279 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTGFP29279 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTGFP29279 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTGFP29279 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTGFP29279 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTGFP29279 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms