Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms