Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD3P28288 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD3P28288 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms