Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms