Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms