Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO1P25800 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO1P25800 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO1P25800 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO1P25800 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO1P25800 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms