Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms