Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms