Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms