Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms