Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CXCL3P19876 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL3P19876 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms