Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCLP19338 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLP19338 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLP19338 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCLP19338 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCLP19338 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCLP19338 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCLP19338 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCLP19338 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLP19338 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLP19338 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms