Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms