Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR1P18146 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms