Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPI1P17947 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPI1P17947 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPI1P17947 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms