Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms