Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRAP16234 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRAP16234 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRAP16234 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRAP16234 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRAP16234 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRAP16234 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRAP16234 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms