Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MUC1P15941 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MUC1P15941 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MUC1P15941 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC1P15941 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MUC1P15941 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MUC1P15941 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms