Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF4P15884 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF4P15884 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF4P15884 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF4P15884 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF4P15884 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF4P15884 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF4P15884 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF4P15884 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF4P15884 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF4P15884 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF4P15884 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF4P15884 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF4P15884 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF4P15884 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF4P15884 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms