Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A1P13866 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms