Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT10P13645 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT10P13645 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT10P13645 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT10P13645 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT10P13645 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT10P13645 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT10P13645 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT10P13645 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT10P13645 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT10P13645 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms