Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CFTRP13569 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFTRP13569 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFTRP13569 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFTRP13569 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFTRP13569 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFTRP13569 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CFTRP13569 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CFTRP13569 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CFTRP13569 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CFTRP13569 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CFTRP13569 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFTRP13569 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFTRP13569 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFTRP13569 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFTRP13569 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFTRP13569 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFTRP13569 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFTRP13569 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFTRP13569 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFTRP13569 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFTRP13569 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFTRP13569 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CFTRP13569 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms