Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms