Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB1P11230 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms