Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI2P10070 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI2P10070 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI2P10070 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI2P10070 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI2P10070 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI2P10070 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI2P10070 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI2P10070 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI2P10070 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI2P10070 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI2P10070 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI2P10070 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI2P10070 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI2P10070 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI2P10070 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI2P10070 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI2P10070 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI2P10070 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI2P10070 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI2P10070 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI2P10070 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI2P10070 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI2P10070 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI2P10070 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI2P10070 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI2P10070 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI2P10070 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI2P10070 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI2P10070 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI2P10070 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI2P10070 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI2P10070 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI2P10070 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI2P10070 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI2P10070 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI2P10070 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI2P10070 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI2P10070 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI2P10070 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI2P10070 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI2P10070 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms