Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNHG28P0DPA3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms