Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms