Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms