Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms