Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47B1P0C2W7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47B1P0C2W7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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