Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NGFRP08138 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NGFRP08138 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms