Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOP08100 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOP08100 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOP08100 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOP08100 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOP08100 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOP08100 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOP08100 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOP08100 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOP08100 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms