Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB1P08034 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB1P08034 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB1P08034 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB1P08034 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB1P08034 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB1P08034 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms