Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-5P01602 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms