Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms