Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1O95273 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNDBP1O95273 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNDBP1O95273 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNDBP1O95273 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNDBP1O95273 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms