Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8BO95263 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms