Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms