Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms