Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIG2O94898 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIG2O94898 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIG2O94898 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms