Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UFL1O94874 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UFL1O94874 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UFL1O94874 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UFL1O94874 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UFL1O94874 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UFL1O94874 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UFL1O94874 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UFL1O94874 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UFL1O94874 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UFL1O94874 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UFL1O94874 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UFL1O94874 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms