Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL5O76039 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms