Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIOO75962 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIOO75962 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIOO75962 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIOO75962 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIOO75962 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIOO75962 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIOO75962 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIOO75962 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIOO75962 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIOO75962 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIOO75962 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIOO75962 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIOO75962 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIOO75962 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIOO75962 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIOO75962 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms