Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms